Архієпископ Болеслав Клопотовський народився 13 березня 1848 року у шляхетській сім'ї у родинному маєтку у Головченцях (з 1955 року - Кармелюкове) на Поділлі. Навчався у повітовій школі в Золотополі, з 1862 році у ІІ Державній гімназії в Києві та з 1865 року у Житомирській Духовній семінарії. У 1869-1873 роках продовжив навчання в Духовній академії в Санкт-Петербурзі, де одержав ступінь маґістра. 15 липня 1872 року отримав священничі свячення у Санкт-Петербурзі.
Повернувшись у Житомир, спочатку працював вікарієм у семінарійному костелі, а з 1874 року - викладачем історії Церкви, моральної теології та латинської мови у семінарії. У 1876 році став інспектором семінарії. Після закриття семінарії у Житомирі з 1877 року читав канонічне право та історію Церкви в Духовній академії у Петербурзі. Великою популярністю славився його підручник із історії Церкви. 1884 року став інспектором, а в 1897 році ректором академії. У 1885 році за праці в галузі церковної історії удостоєний ступеня доктора наук.
2 серпня 1897 року призначений титулярним єпископом Елевтерополіським та єпископом-помічником Луцько-Житомирської дієцезії. 21 листопада цього ж року відбулось рукоположення в єпископи в костелі св. Катерини у Санкт-Петербурзі. Вже через кілька місяців, після смерті єпископа-ординарія Кирила Любовідзького обраний 14 червня 1898 року капітульним вікарієм дієцезії. 14 грудня 1899 року призначений новим єпископом-ординарієм Луцько-Житомирським та Апостольським адміністратором Кам'янець-Подільської дієцезії.
Втім, менше ніж через два роки, 26 квітня 1901 року був номінований митрополитом-архієпископом Могильовським. Інтронізація відбулась 23 червня цього ж року у костелі св. Катерини у Санкт-Петербурзі. У 1901-1902 роках впровадив у богослужіння латинську мову, тоді як для катехизації визначалась та мова, якою розмовляли парафіяни. Помер 24 лютого 1903 року у Санкт-Петербурзі та був похований 28 лютого в крипті цвинтарної святині Відвідання Єлизавети Дівою Марією на Виборзькому кладовищі.